El CCT CONICET PATAGONIANORTE administra cuatro institutos: el CIEMEP, el IIDyPCa, el INIBIOMA y el PROBIEN.

Estos Institutos son unidades de investigación y servicio que, bajo la responsabilidad de un director, realizan tareas de investigación científica, tecnológica o de desarrollo, organizadas en variadas líneas de trabajo. Cuentan con una infraestructura de personal y equipamiento adecuada a la índole de su actividad y forman investigadores y técnicos.