Se denominan "Unidades Asociadas" a aquellas instituciones con las que el CONICET establece convenios en mérito a su relevancia científico-tecnológica.

Estas UA brindan lugares de trabajo para investigadores/as, Personal de Apoyo y Becarios/as del organismo.

En el caso de las UA, la relación no implica ningún tipo de compromiso económico por parte del CONICET para contribuir al mantenimiento de dichas unidades. Por otra parte, la elección de autoridades y el modo de gobierno de la UA será de exclusiva incumbencia de la institución de contraparte, manteniendo la individualidad y autonomía de sus respectivas estructuras técnicas y administrativas; y asumiendo sus responsabilidades consiguientes. En la región, el CCT CONICET Patagonia Norte cuenta con dos unidades asociadas: Fundación Bariloche y CIEFAP.